Общий фонд научно-медицинской библиотеки (НМБ) составляет 150010 печатных единиц, в т.ч. библиотека располагает фондом диссертаций, защищенных в Центре (2879 экз.), авторефератов сотрудников Центра и других научно-исследовательских учреждений (11744 экз.).
Фонд НМБ отражен в справочно-поисковом аппарате (СПА), состоящем из нескольких связанных между собой каталогов и картотек, среди которых главными являются:
- алфавитный (на все виды литературы),
- предметный (на книги и авторефераты),
- систематический (на диссертации),
- картотека трудов сотрудников Центра,
- картотека персоналий и др.
Значительную часть СПА составляют энциклопедии, справочники общие и отраслевые, различные словари.
НМБ по подписке получает отечественные журналы в количестве 80 наименований.