Лаборатория организована в 2004 году на основе молекулярно-биологической группы лаборатории иммунохимии.
Прогрессия эпителиальных опухолей сопровождается снижением уровня дифференцировки, ускорением пролиферации, потерей эпителиальной морфологии, приобретением инвазивности и способности к метастазированию. Ключевую роль в регуляции этих процессов играют тканеспецифические транскрипционные факторы.
Основная часть исследований проводится на экспериментальных системах и клинических образцах гепатоцеллюлярных карцином (ГЦК), самой распространенной формы опухолей печени, и протоковой аденокарциномы поджелудочной железы человека. На модельной системе одноступенчатой прогрессии ГЦК мышей in vivo впервые описана ключевая роль подавления функции гепатоцитарного ядерного фактора HNF4А в прогрессии опухолей печени. Показано, что восстановление экспрессии HNF4А в клетках дедифференцированной ГК вызывает активацию гепатоцитарных генов, снижение подвижности клеток, восстановление эпителиальной морфологии и замедление пролиферации. При подкожной перевивке животным клетки с восстановленной экспрессией HNF4А дают начало опухолям с существенно сниженной скоростью роста и подавленным метастатическим потенциалом. Проводимый в сотрудничестве с НИИ клинической онкологии анализ клинических образцов показал, что подавление экспрессии тканеспецифических регуляторов транскрипции наблюдается и в опухолях человека. Все эти данные указывают на то, что нарушение функции тканеспецифических транскрипционных факторов, определяющих дифференцировку клеток печени, является важным этапом в прогрессии ГЦК.
С помощью методов высокопроизводительного анализа транскриптома нормальных и опухолевых тканей печени выявлен ряд генов, вовлеченных в прогрессию ГЦК, и потенциальных маркеров гепатоканцерогенеза.
Основными направлениями исследования лаборатории в настоящее время являются:
- Идентификация новых детерминант прогрессии эпителиальных опухолей (мутации, хромосомные перестройки, изменения транскрипционного профиля, аллель-специфическая экспрессия генов) на основе анализа данных массового параллельного секвенирования
- Исследование механизмов влияния тканеспецифических транскрипционных факторов на функциональные, морфологические и ростовые характеристики опухолей печени и поджелудочной железы.
- Анализ механизмов, определяющих роль опухолевого супрессора HNF4А в прогрессии злокачественных новообразований.
- Разработка методов идентификации драйверных соматических мутаций, а также эпигенетических нарушений (аллель-специфическая экспрессия генов, регуляция транскрипции, метилирования генов) в опухолевой ткани и циркулирующей ДНК.
