Компьютерная  База данных по противоопухолевым веществам разработана с использованием СУБД ISISBase MDL Information Systems, Inc. (http://www.mdli.com/products/framework/isis), имеет объем около 18000 килобайт, содержит химические формулы, номенклатурные данные, физико-химические свойства, результаты изучения биологической активности около 12000 синтетических веществ и природных экстрактов, изучавшихся в отделе экспериментальной химиотерапии с 1952 года по настоящее время в качестве потенциальных противоопухолевых препаратов.

            Структура БД делится на 2 блока: номенклатурно-химический и биологический.

Номенклатурно-химический модуль

Ø       Различные шифры

Ø       Тривиальные названия и синонимы на русском и английском языках

Ø       Химические названия по различным номенклатурам, в том числе обязательно по IUPAC, на русском и английском языках

Ø       Химический класс

Ø       Структурная формула

Ø       Элементный состав

Ø       Брутто-формула

Ø       Молекулярный вес

Ø       Данные по стерео и оптической изомерии

Ø       Температура плавления и кипения

Ø       Плотность

Ø       Агрегатное состояние

Ø       Внешний вид

Ø       Гигроскопичность

Ø       Стабильность

Ø       Условия хранения

Ø       Растворимость в различных растворителях

Ø       Сведения об авторах

Для веществ природного происхождения дополнительно приводятся данные о таксономии организма – источника выделения вещества, месте и времени сбора сырья, способе получения экстракта и его фракций

Поля номенклатурно-химического блока содержат данные, обычно известные к моменту передачи вещества на биологическое изучение, которые вводятся в Базу данных при первичной регистрации вещества. Это модуль номенклатурных данных, позволяющие однозначно идентифицировать вещество, и модуль химических данных, характеризующих химический состав, строение и физико-химические свойства вещества в объеме, необходимом эксприментаторам для корректного проведения биологического изучения и полноценного анализа его результатов. Основная часть данных номенклатурно-химического блока получена эмпирическим путем и вводится в Базу данных  из паспортов, составленных авторами вещества. Есть также данные, генерируемые средствами СУБД ISISBase после ввода структурной формулы вещества (химическое название по системе IUPAC, рассчитанный по элементный состав). В структуру Базы данных введены также поля, содержащие рассчитываемые специальными средствами данные, характеризующие «лекарствоподобие» или «нелекарствоподобие» вещества:  logP (логарифм коэффициента распределения в системе «октанол – вода», характеризует различную растворимость вещества в двух несмешивающихся растворителях, может быть рассчитан с помощью различных компьютерных программ); H_Donors (число донорных водородных связей в молекуле); H_Accept (число акцепторных водородных связей в молекуле); Rot_Bond (число вращающихся связей в молекуле).

Биологический модуль

Содержит полученные в стандартных условиях одного учреждения по одним и тем же методикам качественные и количественные данные по результатам изучения:

 

 В культуре опухолевых клеток: 

цитотоксической активности

 

На животных: 

противоопухолевой активности

общетоксических свойств

 

 

В блоке данных по цитотоксической активности приведены названия линии клеток, способ оценки цитотоксической активности, время экспозиции клеток в присутствии вещества, торможение роста клеток (в %), CE₅₀

 

В блоках данных по противоопухолевой активности и токсичности приведены названия опухолевой модели, вида и линии животных, путь и режим введения вещества, растворитель, торможение роста опухоли (в %), увеличение продолжительности жизни (в %), показатели индукции ремиссий и излеченности, значения летальных доз

 

 

Представленные в Базе данных результаты экспериментального изучения биологической активности получены в стандартизованных экспериментальных условиях одного учреждения по одним и тем же методикам и имеют количественный характер. Это придает данным по биологической активности дополнительную ценность при их использовании в аналитических исследованиях по связи структура – активность, в том числе для формирования обучающих массивов систем компьютерного прогнозирования биологической активности веществ по их химической структуре.